Кафедра «Управление эксплуатационной работой железной дороги» (до 1981 года «Организация движения поездов») была организована со дня образования института в 1931 году. В период с1931года по 1932 год кафедрой заведовал инженер В.В. Домбровский, а с 1932 по 1938 года –начальник отдела планирования юго-западной железной дороги В.П.Рафальский. В те годы на факультете была только одна кафедра, из состава которой выделились кафедры «Организация движения поездов», «Организация грузовой и коммерческой работы», «Железнодорожные станции и узлы» и «СЦБ и связь».

Большой вклад в развитие учебного процесса, базы научно-технической лаборатории и кафедры внесли профессора Л.В. Одинцов, Р.З.Нурмухамедов, доценты В.И. Аксёнов, С.Р.Рихсиев, Г.А.Мирзаева, С.К. Худайберганов и др.

Кафедрой руководили:

1994-1999 года д.т.н., проф. К.Т. Худайберганов;

1999-2009 года к.т.н., доц.Г.А. Мирзаева;

с 2009 года и по сей день к.т.н., доц. С.К.Худайберганов.

Долгое время на кафедре работали кандидаты технических наук доценты В.Н. Белов, К.А.Кулманов, А.П.Троицкий, М.Е. Сияница, М.Н. Адилов, Ш.Н.Норматов, Г.А.Мирзаева, Э.И.Домкин, С.Р.Рихсиев, старшие преподаватели Л.П. Власова, Л.В. Чахмахсазианц и ассистент Ю.П. Мясников.

Кафедра уделяет большое внимание учебно-методической и научно-исследовательской работе.

Под руководством профессорско-преподавательского состава кафедры разрабатываются курсовые и квалификационные работы. Результаты научно-исследовательской работы нашли свое отражение в монографиях и научных трудах членов кафедры д.т.н., проф. Р.З. Нурмухамедова более 100 печатных работ из них 8 монографий, проф. К.Т. Худайберганова также более 100 печатных изданий из них 5 монографий. Учебное пособие проф. Нурмухамедова Р.З. «Управление эксплуатационной работой железных дорог» широко используется в учебном процессе. За последние годы членами кафедры были изданы учебники и учебные пособия по дисциплинам кафедры на государственном и русском языках.

В настоящее время в основном штате кафедры работают 17 преподавателей, из них 4 кандидата технических наук и 3 доктора философии (PhD).

Научно-исследовательская деятельность кафедры осуществляется по следующим основным направлениям:

– Организация местной работы железных дорог на основе ресурсосберегающих технологий;

– Развитие пропускной и провозной способности железных дорог;

– Комплексное планирование и прогнозирование объёмов эксплуатационной работы с помощью компьютерных технологий;

– Улучшение эксплуатационной работы железных дорог на основе инновационных технологий;

– Разработка технологических процессов станций и подъездных путей и др.

На базе АО «Ўзбекистон темир йуллари» были организованы филиалы кафедры по сортировочной станции “Чукурсай” и грузовой станции “Хамза”, где проводятся практические, лабораторные занятия. Студенты 2-4 курсов проводят производственной и преддипломной практики.

Кафедра тесно сотрудничает с АО «Ўзбекистон темир йуллари», в частности участвовала в разработке технологических процессов работы станций: 2005г. – для станции «Сергели», 2006 г. – «Ташкент-товарная», 2007 г. – «Тукимачи», 2008 год – «Джизак», 2009-2010 годах – «Ангрен», за последние годы станций Бекабад, Чукурсай, Назарбек и др.

В 2001 году на кафедре была организована магистратура, которую закончили более 140 человек. Многие научные работы магистрантов подготовлены по тематике актуальных для АО «Ўзбекистон темир йуллари».

В целях подготовки кадров для транспортного сектора, внедрения в систему зарубежного опыта и международных стандартов, а также повышения научного потенциала отрасли было принято Постановление Президента «О мерах по кардинальному совершенствованию системы подготовки кадров в сфере транспорта» (№ ПП–4703, 04.05.2020 г.). В результате объединения Ташкентского института инженеров железнодорожного транспорта, Ташкентского института проектирования, строительства и эксплуатации автомобильных дорог и факультета авиакосмических технологий Ташкентского государственного технического университета был создан Ташкентский государственный университет транспорта. С этого времени  кафедра “Управление эксплуатационной работой железной дороги” была переименована в “Организация движения на транспорте”.